我们到了吗?——18个月后，covid - 19和实验室。
Wayne Dimech回顾了SARS-Cov-2检测的质量挑战。一年多过去了，我们做得更好了吗?Wayne Dimech是澳大利亚墨尔本NRL科学与商业关系执行经理。他是传染病血清学和实验室质量方面公认的专家。
“我们到了吗?”18个月后，covid - 19和实验室。
Wayne Dimech, B. apple Sci;MASM;实现工商管理硕士;饿了;FRCPA(理学院)
2021年7月
最近，我有幸在一次晚宴上与我的微生物学大学讲师交谈。当他讲述他作为一名年轻科学家在战后英国研究天花的经历时，我被迷住了。这让我想知道，我们作为科学家在未来几年研究COVID-19的经验应该如何讨论。疫情已影响到所有国家和我们生活的方方面面。未来许多评论员将从经济和卫生方面审查每个国家的应对措施，但在大流行发生18个月后，审查医学实验室科学的成功并评估如果我们将来面临类似情况，我们可以在哪些方面进行改进是及时的。
我首先想到的是感谢所有国家应对疫情的中坚力量——医学实验室的科学家和技术人员。面对病人的卫生工作者因其不知疲倦和勇敢的工作而受到赞扬，这是非常正确的;但实验室工作人员每天24小时都在悄悄地警惕地测试了无数次SARS-CoV-2测试;大流行的每一天似乎都是无情的。正常的名册被放弃，工人们被重新训练和重新部署。实施夜班，引进新的仪器和技术。每天早上，世界各地的卫生部长在媒体面前报告进行的检测数量和发现的阳性病例数量。提供测试结果的实验室工作人员很少得到信任，如果有的话。因此，我想借此机会感谢每一位实验室工作者在过去18个月里所做的贡献。
临床样本检验只是医学科学贡献的一小部分。在SARS-CoV-2被检测到并被认为是一种重要病原体的几周内，科学家们就对病毒基因组进行了测序。在一个月内，诸如我的家乡墨尔本的彼得·多尔蒂研究所(Peter Doherty Institute)等组织培育出了这种病毒，使研究人员、参考实验室和质量保证提供者能够开展活动。截至2020年1月，全球临床和参考实验室已经开发出内部核酸检测(NAT)，可以进行大规模筛查，并发现和隔离潜在病例。同时，中国疾控中心、美国疾控中心、charit
同样，体外诊断设备(IVD)行业的贡献也非常突出。到2020年7月，市场上有700多种商用SARS-CoV-2检测方法。考虑到新的IVD上市时间通常以年而不是月来衡量，这一点很突出。使用内部分析的实验室检测是不可持续的。获得按质量流程批量生产的商业静脉注射药物对于维持实验室应对至关重要。除了NAT ivd的制造商外，现实情况是，许多此类ivd不一定具有商业可行性，而是作为应对大流行的措施推向市场。ivd上市时有效期较短，导致试剂过期造成损失。毫无疑问，最初的决定是为了潜在的经济利益而做出的，但是决定保留不可行的产品使科学家能够从更大的选择范围中进行选择。取得这一成果的环境中存在着对原材料的竞争、对工作人员流动的限制以及在制造国经常发生当地传染，限制了对工程师和客户的正常培训。计划中的发展渠道被放弃，资源被重新用于COVID-19活动。 This research and development of new products and the process for bringing them to market was also led by medical scientists.
我们还能做得更好吗?我相信我们的方法在某些方面可以改进;主要与由于大流行病的性质而未遵守的既定原则有关。
如上所述，大量的检测试剂盒在短时间内被推向市场。这些测试包的许多制造商以前没有传染病方面的经验，因此，假设其中一些测试可能不适合目的并非没有道理。在这种情况下，监管当局应支持实验室选择检测包，确保在其管辖范围内只销售高质量的检测。现有的基于病原体对个人和社区的风险的监管要求被用于批准ivd的销售。风险最高的类别涉及用于筛查对个人和社区构成风险的感染的检测试剂盒。毫无疑问，SARS-CoV-2属于这一类。在一般情况下，制造商必须证明ivd是安全的，符合基本原则并适合用途。需要一份全面的档案，详细说明测试试剂盒对预定义标准的性能。虽然有时被视为障碍，但这些要求是确保测试质量的重要机制。
在COVID-19情况下，所有主要监管机构都允许将SARS-CoV-2检测试剂盒列为紧急使用授权(EUA)。监管机构依赖于制造商提供的最少性能数据，而不是进行独立的性能测试。在注册之前对测试试剂盒性能的综合证据的要求基本上被删除了。在欧盟委员会，COVID-19检测试剂盒是自我声明的，允许制造商在检测试剂盒上附加CE IVD认证，而无需经过公告机构的独立审查。具有讽刺意味的是，从2022年初开始，根据IVDR规定，SARS-CoV-2检测试剂盒将被列为最高风险类别(D类)，类似于艾滋病毒和肝炎检测。美国FDA“建议开发人员通过测试至少30个阳性标本和30个阴性标本来确认其测定方法的性能。如果您无法获得经授权检测确定的临床样本，则可以考虑使用人造临床样本。”请注意，“授权测定”注册为EUA。使用30个阳性/阴性样本几乎不足以对先前评估的IVD进行实验室验证。澳大利亚治疗药品管理局(TGA)允许将SARS-CoV-2检测试剂盒注册为紧急用途。 Only rapid device tests (RDT) for serology are required to undergo a “post-market evaluation”, which the National Serology Reference Laboratory, Australia (NRL) is conducting under contract to the Peter Doherty Institute.
这种情况导致了SARS-CoV-2检测试剂盒的开放获取，但也限制了获取科学可靠的性能信息的途径。因此，许多国家报告花费了数百万美元购买由于性能差或不适合用途而无法使用的检测试剂盒。虽然监管机构认为有必要取消对重要诊断工具的使用限制是可以理解的，但这种方法向不熟悉监管要求的潜在用户发出了一个信号，即在EUA注册的检测试剂盒已经经历了用于所有其他ivd的严格监管程序。这种情况给实验室增加了额外的压力，这些实验室要么需要自己评估检测结果，要么依赖公开的信息。不幸的是，大多数实验室没有能力或专业知识来进行适当设计的研究，导致大量的重复工作。
使这种情况更加复杂的是，知名科学期刊和其他媒体都随时发表未经同行评议的文章。对信息的需求很高，特别是在大流行的早期，科学家们热衷于分享他们的发现。然而，IVD性能的评估是一个专门的学科，许多出版物都存在缺陷，不同的研究报告了相同IVD的严重不同的敏感性和特异性。这会导致混淆，并可能导致不正确的关注，即测试试剂盒的性能不足，或某些ivd适合用途的错误安全感。与监管机构一样，科学家也将科学期刊视为可靠和值得信赖的信息来源。研究方法结构不良，使用小样本集和很少的检测试剂盒，得出不适当的结论和解释，导致难以理解现有检测试剂盒的性能。
一些机构已经提供了所需的清晰度。世界卫生组织(世卫组织)在支持获取静脉注射药物综合绩效数据方面一直处于领先地位。世卫组织委托NRL对40个SARS-CoV-2血清学RDTs和环境影响评估进行全面评估，使用同一组样本，包括血清转换面板以及干扰和交叉反应样本。独立地，NRL也为自动检测的制造商提供这项服务。研究结果将很快在NRL网站上公布(www.nrlquality.org.au）.创新诊断方法基金会与日内瓦大学医院合作，也使用了相同的样品组，对分子测定法进行了大规模评价。保罗·埃利希研究所(德国兰根)使用相同的样本面板对SARS-CoV-2抗原检测试剂盒进行了评估。
现在，自大流行爆发18个多月以来，我们正在经历一种新的“正常”感觉。数字仍然很高，封锁仍然存在，但在许多国家已经实施了应对机制。这也是实验室科学的情况。我们对可以使用的工具有了更深入的了解;过程开发;员工培训。我们有更多的时间来理解和应对这种情况。18个月后呢?在我们现在生活的世界里，很难预测。如果出现一种新的疫苗突破菌株怎么办? Or if vaccine hesitancy is heightened? Countries without good access to vaccination will remain a reservoir for shedding into other countries, underlining the need for all countries to support each other’s access to the vaccine.
我确实预测，与SARS-CoV-1不同，该病毒将在未来几年在社区中存在，因此对我们的卫生系统构成持续和永远存在的挑战;特别是在实验室里。随着人口接种疫苗和病毒得到抑制，将需要进行快速检测，以帮助那些选择这种方法的国家遏制残余病毒的传播。关于“疫苗护照”效力的决定仍有待做出。这种方法可能依赖于疫苗接种的证据，也可能依赖于抗体检测的实验室证据。在进入某些国家之前，有要求接种黄热病疫苗的疫苗护照的先例，但这种做法的效力仍有争议。
医学实验室科学家和技术人员将继续在确保我们社区的健康方面发挥重要作用，并继续测试越来越多的棉签，开发和验证新程序，以越来越快的速度报告结果，并保持所有其他病理测试的质量。
我希望医务化验人员的特别努力能得到社会的公开认可。
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韦恩Dimech是世界卫生组织(世卫组织)艾滋病毒和艾滋病及其他血源性感染诊断和实验室支持合作中心NRL的科学和商业关系执行经理。Dimech先生在墨尔本皇家墨尔本理工学院(RMIT)获得医学实验室科学学位，之后在澳大利亚医学科学家研究所获得微生物学奖学金，并在墨尔本拉特罗布大学完成工商管理硕士学位。他也是澳大利亚皇家病理学家学院科学(研究)学院的研究员。他曾在私营和公共病理学实验室工作，主要在微生物部门，在那里他专门研究传染病血清学。Dimech先生的研究兴趣包括检测和监测血液传播和性传播传染病的检测方法的控制和标准化。特别感兴趣的是风疹检测的标准化和传染病检测变异性的监测。他在开发EDCNet(一个基于互联网的质量控制测试结果监控程序，现已在全球范围内使用)和优化OASYS(用于管理外部质量评估方案的软件)方面发挥了重要作用。Dimech先生是许多国家和国际工作组的顾问，包括澳大利亚乙型肝炎检测战略、澳大利亚标准以及世卫组织、《国际卫生条例》、开发署和全球基金支持下的咨询公司。他在国际同行评审期刊上撰写或合作撰写了约50篇文章，并为三本书的章节做出了贡献。